Novim elektroničkim sustavom, naplatne kućice te fizička naplata gotovinom ili karticom odlaze u povijest, a sama naplata će se odvijati automatski, odnosno u slobodnom toku prometa. Predviđena su dva glavna načina korištenja sustava. Jedan je putem elektroničkog uređaja, odnosno ENC-a, a predviđen je za korisnike koji se registriraju u sustav i sklope ugovor. U ovom slučaju naplata se provodi automatski, u stvarnom vremenu. Drugi način je automatsko prepoznavanje registarskih pločica (APRP sustav), a predviđen je za korisnike koji nisu registrirani. U njihovom slučaju sustav snima registarsku tablicu, a cestarina im se naknadno zaračunava u skladu s pravilima koncesionara. Za korištenje sustava nužno je biti uključen u ESNC, što znači da se svaki vozač mora identificirati putem ENC-a, EENC-a ili registracije u APRP modelu.
Novi Zakon predviđa da će se postojeći ENC uređaji moći nastaviti koristiti i nakon uvođenja novog sustava, ali će morati biti usklađeni s novim pravilima. Za teška vozila (iznad 3.5 tona) ENC će biti obvezan. Poštivanje pravila korištenja sustava naplate provodit će nadzornici u bijelim automobila s plavim rotirkama.